Publicado: 2005-12-15

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Diferenciación de especies de Rhodococcusmediante una prueba de PCR-RFLP basada en los genes codificantes para la subunidad 16S ribosomal

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Artículo original

Autores/as

Paula Pavia
Laboratorio de Parasitología Molecular, Departamento de Microbiología, Pontificia Universidad Javeriana. , Colombia
Camila Calderón
Laboratorio de Parasitología Molecular, Departamento de Microbiología, Pontificia Universidad Javeriana. , Colombia
Concepción Puerta PhD
Laboratorio de Parasitología Molecular, Departamento de Microbiología, Pontificia Universidad Javeriana. , Colombia
Dada la dificultad en diferenciar las especies de Rhodococcus por pruebas bioquímicas, se desarrolló una prueba de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR), seguida de un ensayo de Polimorfismo de Longitud de Fragmentos de Restricción (PCR-RFLP) para la diferenciación de las mismas. R. equi, R. rhodnii y otras bacterias fueron cultivadas en agar sangre y BHI a 37 y 26 °C. El ADN bacteriano fue extraído y amplificado con los iniciadores descritos por Hypsa y Dale. Los productos de amplificación fueron sometidos a digestión con diversas enzimas de restricción y los patrones de restricción obtenidos fueron confirmados mediante análisis in silico. Se obtuvo el fragmento de amplificación esperado de 1300 pb en todas las bacterias analizadas. Se pudo diferenciar R. equi de R. rhodnii con las endonucleasas PstI y HindIII y con respecto a otras bacterias con PstI, HindIII, SstI, BamHI y EcoRI. Los patrones de restricción obtenidos fueron confirmados mediante análisis in silico. La prueba PCR-RFLP constituye una alternativa para la diferenciación entre especies de Rhodococcus tales como R. equi y R. rhodnii.

Diferenciación de especies de Rhodococcusmediante una prueba de PCR-RFLP basada en los genes codificantes para la subunidad 16S ribosomal

Autores/as

  • Paula Pavia Laboratorio de Parasitología Molecular, Departamento de Microbiología, Pontificia Universidad Javeriana.
  • Camila Calderón Laboratorio de Parasitología Molecular, Departamento de Microbiología, Pontificia Universidad Javeriana.
  • Concepción Puerta PhD Laboratorio de Parasitología Molecular, Departamento de Microbiología, Pontificia Universidad Javeriana.

DOI:

https://doi.org/10.22490/24629448.332

Palabras clave:

Rhodococcus, R. equi, R. rhodnii, PCR-RFLP

Resumen

Dada la dificultad en diferenciar las especies de Rhodococcus por pruebas bioquímicas, se desarrolló una prueba de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR), seguida de un ensayo de Polimorfismo de Longitud de Fragmentos de Restricción (PCR-RFLP) para la diferenciación de las mismas. R. equi, R. rhodnii y otras bacterias fueron cultivadas en agar sangre y BHI a 37 y 26 °C. El ADN bacteriano fue extraído y amplificado con los iniciadores descritos por Hypsa y Dale. Los productos de amplificación fueron sometidos a digestión con diversas enzimas de restricción y los patrones de restricción obtenidos fueron confirmados mediante análisis in silico. Se obtuvo el fragmento de amplificación esperado de 1300 pb en todas las bacterias analizadas. Se pudo diferenciar R. equi de R. rhodnii con las endonucleasas PstI y HindIII y con respecto a otras bacterias con PstI, HindIII, SstI, BamHI y EcoRI. Los patrones de restricción obtenidos fueron confirmados mediante análisis in silico. La prueba PCR-RFLP constituye una alternativa para la diferenciación entre especies de Rhodococcus tales como R. equi y R. rhodnii.

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2005-12-15

Cómo citar

Pavia, P., Calderón, C., & Puerta PhD, C. (2005). Diferenciación de especies de Rhodococcusmediante una prueba de PCR-RFLP basada en los genes codificantes para la subunidad 16S ribosomal. Nova, 3(4), 14–20. https://doi.org/10.22490/24629448.332

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Artículo original